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査読付き論文

15. Ochi, H., Tamai, T., Nagano, H., Kawaguchi, A., Sudou, N. and Ogino, H.
Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of Pax2 and Pax8. Nature Communications 3, Article number: 848 (2012)

14. Kawaguchi, A., Ochi, H., Okano, M., Sudou, N. and Ogino, H.
Co-expression of the H3K27 demethylases, JMJD3 and UTX, with the H3K27 methylase, EZH2, during Xenopus embryonic development.
Int. J. Dev. Biol., 56: 295-300 (2012)

13. Ogino, H., Ochi, H., Reza, H. M., and Yasuda, K.
Transcription factors involved in lens development from the preplacodal ectoderm. Dev. Biol., 363: 333-47 (2012)

12. Hosokawa, Y., Ochi, H., Iino, T., Hiraoka, A. and Tanaka, M.
Photoporation of biomolecules into single cells in living vertebrate embryos induced by a femtosecond laser amplifier.
PLoS ONE, 6(11): e27677 (2011)

11.Yokoyama, H., Maruoka, T., Ochi, H., Aruga, A., Ohgo, S., Ogino, H. and Tamura, K.
Different requirement for Wnt/β-catenin signaling in limb regeneration of larval and adult Xenopus. PLoS ONE, 6(7): e21721 (2011)

10. Sato, S., Ikeda, K., Shioi, G., Ochi, H., Ogino, H., Yajima, H. and Kawakami, K.
Conserved expression of mouse Six1 in the pre-placodal region (PPR) and identification of an enhancer for the rostral PPR.
Dev. Biol., 344(1):158-171 (2010)

9. Sakamoto, K., Onimaru, K., Munakata, K., Suda, N., Tamura, M., Ochi, H. and Tanaka, M. Hetrochronical shift in Hox-mediated activation of Sonic hedgehog led to the  morphological changes during vertebrate fin evolution.
PloS ONE, 4(4): e5121 (2009)

8. Ochi, H. and Westerfield, M.
Lbx2 regulates formation of myofibrils. BMC Dev. Biol., 9: 13 (2009)

7. Ogino, H. and Ochi, H.
Resources and transgenesis techniques for functional genomics in Xenopus.
Dev. Growth. Differ., 51: 387-401 (2009)

6. Ochi, H., Hans, S. and Westerfield, M.
Smarcd3 regulates zebrafish myogenesis onset.
J. Biol. Chem., 283: 3539-3536 (2008)

5. Ochi, H. and *Westerfield, M.
Signaling networks that regulate muscle development: lessons from zebrafish.
Dev. Growth. Differ., 49: 1-11 (2007)

4. Ochi, H.,Pearson, B. J.,Chuang, P.,Hammerschmidt, M. and Westerfield, M.
Hhip regulates zebrafish muscle development by both sequestering Hedgehog and modulating localization of Smoothened.
Dev. Biol., 297: 127-140 (2006)

3. Ochi, H., Sakagami, K., Ishii, A., Morita, N., Nishiuchi, M., Ogino, H. And Yasuda, K.
Temporal expression of L-Maf and RaxL in developing chicken retina are arranged into mosaic pattern. Gene Expr. Patterns., 4: 489-494 (2004)

2.  Ochi, H., Ogino, H., Kageyama, Y. and Yasuda, K.
The stability of the lens-specific Maf protein is regulated by fibroblast growth factor (FGF)/ERK signaling in lens fiber differentiation.
J. Biol. Chem., 278: 537-544 (2003)

1. Itakura, T, Mahata, S, Hirano, M, Ochi, H. and Ogino, Y.
Cytochrome P450 1A1 cDNA from freshwater teleost medaka (Oryzias latipes)and induction of mRNA by 3-methylcholanthrene in various organs.
Environmental Sciences 9.6, 463-473 (2002)

著書

 

3. Ochi, H., Kawaguchi, A. and Ogino, H.
Differential use of paralogous genes via evolution of cis-regulatory elements for divergent expression specificities, New Principles in Developmental Processes, Springer, Chapter 21 (in press), Kondoh, Hisato, Kuroiwa, Atsushi (Eds.)

2. Ogino, H., Ochi, H., Uchiyama, C., Louie, S. and Grainger, R. M.
Comparative genomics-based identification and analysis of cis-regulatory elements.
Xenopus Protocols, 2nd edition: Post-Genomic Approaches, Methods in Molecular Biology (Humana press), Chapter 17 (ISBN-10: 1617799912; ISBN-13: 978-1617799914).

1.安田國雄、吉田智則、越智陽城
水晶体特異的な発現制御機構
掲載図書:ゲノムからの情報発現
シュプリンガーフェアラーク東京 p189-196 (2002)

その他

越智陽城
発現調節配列の変化を探る
生命誌ジャーナル76号冬号 (2013) (JT生命誌研究館)
http://www.brh.co.jp/seimeishi/backnumber/2012/

学会賞等の受賞

1.  第45回日本発生生物学会 第64回日本細胞生物学会 合同大会
若手優秀ポスター賞 2012年5月

 

競争的研究資金の獲得状況

14. テニュアトラック普及定着事業 (個人選抜型: 越智陽城) 平成25-28年度、研究代表
13. 新学術領域 三次元構造を再構築する再生原理の解明 公募班 平成25-26年度、研究代表12. 新学術領域 ゲノムアダプテーションのシステム的理解 公募班 平成25-26年度、研究代表
11. 岸本基金研究助成 (財)千里ライフサイエンス振興財団 平成25年度、研究代表
10. 日本発生生物学会 17th International Congress of Developmental Biology
       渡航費支援 平成25年度
9. 公益財団法人 武田科学振興財団 ライフサイエンス研究奨励 平成24年度 研究代表者
8. 日本学術振興会 若手研究 (B) 平成24-26年度 研究代表者
7. 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 個別共同利用 (亀井 保博 准教授) 平成24年度
6. 日本科学協会 平成24年度海外発表促進助成 平成24年度
5. 日本学術振興会 若手研究 (B) 平成21-23年度 研究代表者
4.  稲盛財団 平成21-22年度 研究代表者
3.  科学技術振興機構 シーズ発掘試験 平成21年度、研究代表者
2. 日本科学財団 笹川科学助成金 平成21年度 研究代表者
1. 奈良先端科学技術大学院大学支援財団 海外渡航費支援 平成13年度

講演等

10. Haruki Ochi, Hoshijima K. and Ogino H.
Manipulation of On-Off switch for gene expression using TALEN: an advanced tool for genome engineering, 
International Workshop on “Energy Devices and Nanotechnology
2014年3月

9. 越智陽城
ゲノム進化からみた疾患発症•組織再生メカニズムの理解
「生物から医学、そして医療へ」(世話人: 山形大学医学部教育支援センター)
2013年4月

8. Haruki Ochi
Evolution of cis– regulatory elements after whole genome duplications.
パリ第6大学ピエール マリー キュリー(世話人: Staff Scientist, Momose Tsuyoshi)
2012年9月

7. 越智陽城、荻野肇
ゲノム倍化によるシス調節機構の進化
日本進化学会第14回大会 首都大学東京 2012年8月

6. 越智陽城
ゲノム倍化による遺伝子発現調節機構の進化
京都大学情報科学研究科 セミナー  京都大学 2012年6月 (世話人: 京都大学助教 前川真吾)

5. 越智陽城
Skeletal muscle development in zebrafish.
第5回関西小魚セミナー 京都大学農学部 2010年7月 (世話人: 京都大学助教 木下 政人)

4 越智陽城,
筋形成における分化タイミング調節のメカニズム
Molecular mechanisms underlying induction of myogenesis in zebrafish
-Smarcad3 regulates the zebrafish myogenesis onset-,
奈良先端科学技術大学院大学GCOEセミナー 2008年1月 (世話人: 奈良先端大准教授 荻野 肇)

3. Haruki Ochi
Molecular mechanisms underlying induction of myogenesis in zebrafish.
-Smarcd3 regulates the timing of zebrafish myogenesis onset-
東京大学農学部浜名湖実験センター  2007年9月  (世話人: 東京大学助教 菊池 潔)

2. Haruki Ochi
Molecular mechanisms underlying skeletal muscle development in zebrafish.
ゼブラフィッシュの器官形成とイメージング  国立遺伝学研究所 2007年3月

1. 越智陽城、安田國雄
L-Mafのリン酸化・分解制御による水晶体細胞の分化調節機構
第2回 転写研究会 茨木 2003年1月

国際学会

16. Ochi, H., Kawaguchi, A. and Ogino, H.
Evolution of a tissue-specific silencer underlies diversification of paralogous genes17th International Congress of Developmental Biology, Cancun, Mexico, 2013

15. Ochi, H., Tamai, T., Nagano, H., Kawaguchi, A., Sudou, N. and Ogino, H.Paralogous enhancers: a crossover point between developmental robustness and Stress response. The 14th Xenopus international conference, Toulon, France, 2012

14. Ogino, H., Ochi, H., Tamai, T., Nagano, H., Kawaguchi, A. and Sudou, N.
Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of paralogues. The 14th Xenopus international conference, Toulon, France, 2012

13. Takahashi, S., Toyoda, A., Kuroki, Y., Uno, Y., Izutsu, Y., Suzuki, A., Michiue, T., Ogino, H., Ochi, H., Tanaka, T., Fukui, A., Ito, Y., Ueno, N., Asashima, M., Matsuda, Y.,Taira, M. and Fujiyama, A. Analysis of the Xenopus laevis J-strain genome by BAC end sequencing FISH, and RNA-sequence. The 14th Xenopus international conference, Toulon, France, 2012

12. Yajima, H., Suzuki, M., Ochi, H., Ikeda, K., Sato, S., Ogino, H., Ueno, N. and Kawakami, K. Key regulator for development and evolutionary switch form Rohon-Beard cells to dorsal root ganglia. ISDB 71th Annual Meeting, Montreal, Canada, 2012

11. Ochi, H., Tamai, T., Nagano, H., Kawaguch, A., Sudou, N. and Ogino, H. Conservation and diversification of cis-regulatory mechanisms for pax2/5/8 paralog group in chordates. The American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting, Denver, Colorado, USA, 2011

10. Yokoyama, H., Maruoka, T., Ochi, H., Aruga, A., Ohgo, S., Ogino, H. and Tamura, K. Different involvement of Wnt/β-catenin signaling in limb regeneration of larval and adult Xenopus. EMBO Conference Series (3rd) “Molecular and Cellular basis of Regeneration and Tissue, Portugal, 2011

9.  Kawaguchi, A., Ochi, H., Sudou, H., Okano, M. and Ogino, H.
Functional analysis of the histone H3K27 methyltransferase and demethylase in Xenopus embryonic development. The 16th International Conference of the international Society of differentiation, From Stem Cells to Organisms November, Nara, 2010

8. Ochi, H., Uchiyama, C., Kawaguchi, A. and Ogino, H.
Evolution of a fail-safe regulatory system for kidney development.
The 16th International Conference of the international Society of differentiation,
From Stem Cells to Organisms November, Nara, 2010

7. Yajima, H., Suzuki, M., Ochi, H., Ikeda, K., Sato, S., Ogino, H., Ueno, N. and Kawakami, K. Six1 acts as a molecular switch of primary sensory systems from Rohon-beard cells to DRG neurons. Transcriptional meeting, Singapore, 2010

6. Ochi, H., Hans, S. and Westerfield, M.
Molecular mechanisms underlying induction of myogenesis in zebrafish.
2007 Zebrafish Meeting, Amsterdam, the Netherlands, 2007

5. Ochi, H., Hans, S. and Westerfield, M. Baf60c, a subunit of the Chromatin remodeling factor, and Ntl cooperatively regulate early myogenesis in zebrafish. 2006 Zebrafish Meeting, Madison, USA, 2006

4. Ochi, H., Wegner, J., Pearson, B., Chuang, PT., McMahon, AP., Hammerschmidt, M. and Westerfield, M. Hhip regulates zebrafish muscle development by sequestering Hedgehog and promoting internalization of Smoothened. 2005 West coast Zebrafish Meeting, Oregon, USA, 2005

3. Ochi, H., Wegner, J., Pearson B., Chuang, PT., McMahon, AP., Hammerschmidt, M. and Westerfield, M. Cooperation between Hhip1 and Patched regulates zebrafish skeletal muscle development. 4th European Zebrafish Genetics and Development Meeting, Doresden, Germany, 2005 

2. Ochi, H.and Yasuda, K.
FGF/ERK signaling regulates function of L-Maf, a lens differentiation factor. 2002 FASEB Summer Research Conferences Transcriptional regulation during Cell Growth, Differentiation and Development, Vermont, USA, 2002

1.  Ochi, H., Ogino, H.and Yasuda, K.
Regulation of lens differentiation factor L-Maf by phosphorylation. Cold Spring Harbor Laboratory Meetings ‘Mechanisms of Eukaryotic Transcription’ Cold Spring Harbor Laboratory, USA, 2001